Le Laboratoire CGI (Centre de Génie Industriel) a été créé en 1984 par les laboratoires universitaires de Lorient en Bretagne. Il comprenait alors une quinzaine de laboratoires aux spécialités très diversifiées. Parmi ceux-ci, le L.H.P.I. (Laboratoire d'Hygiène Publique et Industrielle) a développé une activité de prestations de services très importante dans le domaine de l'analyse, en particulier liée à l'obtention de l'agrément du Ministère de la Santé, en 1991, pour le contrôle des eaux destinées à la consommation humaine.
La création de l'Université de Bretagne Sud en 1995 a permis à tous les laboratoires universitaires de se regrouper dans un centre de recherche dédié sur le campus de Lorient.
Seule l'activité du laboratoire d'analyse environnementale a été conservée par le Laboratoire CGI.
Celui-ci a mis en oeuvre la construction de nouveaux locaux (2000 m2) adaptés à son activité en 2004.
Aujourd'hui le laboratoire est un laboratoire d'analyse d'eau et de l'environnement reconnu pour ses compétences en terme de recherche de micropolluants organiques et minéraux.